研究内容
次世代シークエンサーによる全ゲノム解析の依頼について
内容
当教室では、医療機関および研究機関から提供された細菌株を対象に、「全ゲノムシークエンス」を実施し、得られたゲノム情報をもとに、分子疫学的特徴や遺伝子背景の解析を行っています。
特に、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、とりわけ MRSA(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus) については、全ゲノム情報に基づく MLST、SCCmec typing、薬剤耐性遺伝子および病原因子関連遺伝子の解析を組み合わせ、臨床的・疫学的観点から総合的な評価が可能です。
対象菌株・位置づけ
本解析は最先端の研究手法を用いたゲノム解析であり、一般的な臨床検査(診断目的)としての精度管理基準を満たすものではありません。そのため、解析結果を直接的に診断や診療方針の決定、治療の選択等に使用することは推奨いたしません。あくまで学術研究および疫学調査のためのデータとしてご活用ください。
解析依頼について
解析を希望される方は、目的および対象菌株の概要を明記のうえ、下記「お問い合わせ」までご連絡ください。
内容を確認のうえ、解析の可否について協議し決定いたします。
なお、本解析においては、解析に使用する試薬代として1株あたり33,000円(税込)のご負担をお願いしております。
解析内容、菌種、株数等により、試薬代が変動する場合がありますので、あらかじめご了承ください。
お問い合わせ
聖マリアンナ医科大学 微生物学講座
准教授 山口 哲央
tetsuo.yamaguchi★marianna-u.ac.jp
(★を @ に変えてください)
※ お電話でのお問い合わせはご遠慮ください。


